妻夫木聡『Get Ready！』4人の闇医者チームの魅力に迫る！

資産運用会社「渋谷キャピタルパートナーズ」のCEO渋谷隆治（池松壮亮）は「特発性間質性肺炎」で余命半年と告知される。

ジョーカー（藤原竜也）が目をつけオペの交渉に行くが、有益な日本の技術を言葉巧みに買収し、海外企業に売り渡すという「ハゲタカファンド」であったことから、エース（妻夫木聡）は執刀を拒否。

しかし、渋谷の片腕として起業時からパートナーだった才津（入江甚儀）の支えもあり、初心に帰り資金不足で困っている町工場を救うために再び尽力するようになる。

その様子を見守っていたエースは「次は無い」としてオペを決行。治療法は、「IPSブロック肺」という人工臓器を移植するという超難関のオペだった。

ジョーカーの元妻、千秋（市川由衣）が訪ねてきた。一人息子を城和大学附属小学校に裏口入学させるために2億円用意しろというのだ。

その大学の坊城理事長（柄本明）は、裏口入学の寄付金で膨大な利益を得ていたが、副理事長で息子の康之（三浦貴大）は、そんな父のやり方に我慢ができず父を解任してしまう。

時を同じくして父が末期の膵臓がんで、余命数ヶ月であることが発覚。

膨大な裏金を作っておいて「自分が死ぬとしても2億円以上は払えない」という理事長に対し、最初は「生かす価値なし」と判断するエースだったが、理事長には誰にも言えない秘密があったことがわかり・・・。

闇医者チームは、ある連続殺人事件を追いかけていた。

警察の捜査が近づく中、エース（妻夫木聡）はなぜかジョーカー（藤原竜也）やクイーン（松下奈緒）の反対を押し切って事件の被害者たちを救い続ける。

実は犯人の安達は（杉本哲太）「原発性脊髄腫瘍」で余命3ヶ月の宣告を受け、3000万でエースに手術を頼んでいた。

チームのメンバーたちは、なぜ連続殺人犯を助ける必要があるのかと戸惑いを隠せない。

彼が連続殺人犯になった隠された理由とは何か？「あと半年だけ生きさせてくれ」というのはなぜか？

闇医者チームは安達を救うために、謎の運び屋（鈴木亮平）と手を組み、警察の目を盗んで安達をオペ室に運ぶが・・・。

天才彫刻家の洋子（美村里江）は、医師から脳腫瘍（グリオーマ）だと告げられる。腫瘍は脳幹まで達しており、手術不能のため余命半年と宣告された。

洋子は残された時間で最期の最高傑作を作ろうと決意する。

そこに現れたのがジョーカー（藤原竜也）。ジョーカーは洋子と6億円で腫瘍の摘出手術をする契約を結ぶ。

ところが、洋子のMRI画像を確認したエース（妻夫木聡）は、彼女が腫瘍が原因で発症した「後天性サヴァン症候群」であることを見抜く。

腫瘍を取り除けば命は助かるが、彫刻家としての才能は失われてしまう。
命をとるか才能をとるか、全てを失っても生きる価値はあるのか。

唯一無二の才能を持った洋子の迷いを、クイーン（松下奈緒）は何とか助けてやりたいと必死になるのだが･･･。

町工場「石川精機工業」の職人・石川智明は、通称クローバー（小林勝也）。エース（妻夫木聡）との付き合いも長い、闇医者チームの特殊機械担当だ。

仮面のメンテナンスを頼みに行ったスペード（日向亘）は、クローバーからエースとの出会いや、エースとジョーカー（藤原竜也）の関係を聞く。

そんな折、一人の女性、渚（小島藤子）がエースを恋人だと勘違いして寄ってくるが、彼女は若年性アルツハイマーを患っていて人の見分けがつかなくなっていたのだ。

さらにその夫・健二（高橋光臣）も「急性壊死性膵炎」に侵されていることを見抜くエース。エースは「救いたい命」としてジョーカーを二人の交渉に行かせる。

当初、夫は手術に乗り気ではなかったがエースに説得されオペを受けることになったのだが・・・。

ジョーカーが選んだ次の患者候補は、パティシエの嶋崎（鶴見辰吾）。

島崎は人生の苦難を乗り越え世界的なパティシエとなったが、事故で右手が動かなくなり第一線を退いていた。おまけに「糖尿病ケトアシドーシス」という病に侵され、もって半年の命。

また、彼はエース（妻夫木聡）の店の常連客・水面みなも（當真あみ）の父親でもあった。

水面の様子に異変を感じていたエースは、その原因を探るためクイーン（松下奈緒）に調査に行かせることに。

水面はぽつりぽつりと話し始めるが、そこには悲しい事実があった。

事情を知ったエースは、父親の嶋崎に「生きる価値」があるのか、娘である水面に命の選別を迫るのだった。

スペード（日向亘）の初恋の人・望月遙（畑芽育）が、校舎から飛び降りて意識不明の重態となった。遙の友人・岡田夏美（池間夏海）の話では、自殺の原因はクラスメイトからのいじめだったと言う。

夏美は仮面ドクターズに救いを求めるが、エース（妻夫木聡）は「自ら死を選んだ人間を救う必要はない」といって無情にもオペを断る。

納得のいかないスペードは遙を救おうと単独行動を始めるが、そこで思いもよらない真実と向き合うこととなり・・・。

エース（妻夫木聡）はジョーカー（藤原竜也）に促され、自分が過去に救えなかった命について語り始める。

エース（天野）は外科医として自信に満ちていた若かりし頃、「オペは完治の入り口でしかない」と語る恩師・真田（榎木孝明）に反発し、剣持（鹿賀丈史）のいる千代田医大へ籍を移したのだ。

そこで出会ったのは、ドナーを待つ少女。若き天才外科医を待っていたのは、あまりにも過酷な運命だった。

千代田医科大学附属病院の理事長である剣持（鹿賀丈史）の娘・玲於奈（結城モエ）が、胃がんの末期。すでに腹膜播種も広がり、もはや手の施しようのない病状であることが判明した。

玲於奈を救えるのはエースしかいないが、ジョーカー（藤原竜也）は剣持との直接対決は避けたほうがいいと断固反対。

正体が暴かれるリスクを恐れ反対するジョーカーと、因縁の相手との直接対決に燃えるエース（妻夫木聡）の意見は真っ向から対立し、ジョーカーはチームから離れてしまう。

そんなチーム解散の気配が漂う中、警視副総監・高城（沢村一樹）の指揮の下、警察の捜査が闇医者チームに迫り始めていた・・・

ジョーカー不在の中、幼い娘を救ってほしいという母親（徳永えり）から闇医者チームに依頼が来る。

交渉に向かうエース（妻夫木聡）だったが、13年前に救えなかった少女と患者を重ねてしまい、トラウマから手が震えオペができる状態ではなかった。

一方、高城（沢村一樹）が指揮する警察の捜査は、闇医者チームの目前まで迫っていた。
危険を察知したジョーカーは、自ら取り調べに応じて高城に“ある取引”を持ちかける・・・